kimia

kimia

Sabtu, 06 Desember 2014

Aplikasi Gabedit Untuk Kimia

Tutorial Aplikasi Gabedit

Haii SOKIM, penulis mau menyapa dulu ah :). Salam semangat untuk SOKIM (Sobat Kimia) pembaca setia, Gimana ini kabarnya? Semoga sehat selalu tentunya. Hehehe, masih semangat kan untuk  pembelajaran kimianya. :) :)

Masih banyak aplikasi kimia  berbasis Linux yang dapat kita gunakan untuk pembelajaran kimia, Untuk kesempatan kali ini ada yang tau aplikasi kimia apa yang bisa digunakan lagi untuk mempermudah kita belajar kimia tentunya ?? Yuupppzzz, Aplikasi Gabedit

Pada kesempatan yang lalu sempat membahas beberapa aplikasi kimia, sekarang kita melanjutkan aplikasi lain dari linux. Mari kita kenalan dulu dan membahas Aplikasi Gabedit, penulis ingin berbagi sedikit pengetahuan dari pengalaman dan mencari dari sumber bacaan lain.
 
Lalu apai itu aplikasi Gabedit ? Gabedit adalah antarmuka pengguna grafis untuk paket kimia komputasi seperti Gamess-AS, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess dan Q-Chem
 
Hal ini dapat menampilkan berbagai hasil perhitungan termasuk dukungan untuk sebagian besar format file utama molekul. The “Molekul Builder” canggih memungkinkan untuk cepat sketsa dalam molekul dan memeriksa mereka di 3D. Grafik dapat diekspor ke berbagai format, termasuk animasi.
Fitur-fitur utama
  • Gabedit dapat Membuat file input untuk GAMESS (AS), GAUSSIAN, Molcas, MOLPRO, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess dan Q-Chem.
  • Gabedit grafis dapat menampilkan berbagai Gamess-AS, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess, Q-Chem, (sebagian) ErgoSCF dan (sebagian) ADF hasil perhitungan, termasuk yang berikut
    • Molecular orbital.
    • Permukaan dari kerapatan elektron, potensial elektrostatik, NMR kepadatan perisai, dan properti lainnya.
    • Permukaan dapat ditampilkan dalam mode jala padat, tembus dan kawat. mereka dapat colorcoded oleh properti terpisah.
    • Kontur (colorcoded), Pesawat colorcoded, Dipole. XYZ sumbu dan sumbu utama molekul.
    • Animasi dari mode normal sesuai dengan frekuensi getaran.
    • Animasi rotasi geometri, permukaan, kontur, pesawat colorcoded, xyz dan sumbu utama molekul.
    • Animasi kontur, Animasi pesawat colorcoded.
  • Gabedit dapat menampilkan spektrum UV-Vis, IR dan Raman dihitung.
  • Gabedit dapat menghasilkan file Povray untuk geometri (termasuk ikatan hidrogen), permukaan (termasuk permukaan colorcoded), kontur, pesawat colorcoded.
  • Gabedit dapat menyimpan gambar di BMP, JPEG, PNG, PPM dan format PS.
  • Gabedit otomatis dapat menghasilkan serangkaian gambar untuk animasi (getaran, konvergensi geometri, rotasi, kontur, pesawat colorcoded).
  • Simulated Annealing dengan Dinamika Molekuler diimplementasikan dalam Gabedit (menggunakan Amber 99 parameter molekul mekanik).

    Hanya sedikit tentang Aplikasi Gabedit yang dibahas ini, Untuk hal lainnya perlu latihan dan belajar penggunaan aplikasi ini untuk mengasah kemampuan. Mungkin banyak kekurangan pada pembahasan aplikasi Gabedit ini. Tapi tentunya aplikais Gabedit ini bisa dikembangkan dan diolah sesuai dengan keinginan pengguna aplikasi ini.

    Semoga bermanfaat kawan  ^_^. Oia jangan lupa komentarnya yah, hehehe. Banyak saran dan kritik itu bagus dan dinanti, tapi saran atau kritik yang membagun dan bahasa yang sopanlah yang lebih baik, ;)
     Salam Ilmiah, Salam Semangat :) :D
     
    Oleh SN ^_^

Tidak ada komentar:

Posting Komentar